Ana Tomašić Paić i suradnici: Biološki čipovi otkrivaju tajne genoma Med Vjesn 2010; 42 (3-4): Biološki čipovi otkrivaju tajne genoma Ana Toma
|
|
- Blagoje Rudolf
- пре 5 година
- Прикази:
Транскрипт
1 Med Vjesn 2010; 42 (3-4): Biološki čipovi otkrivaju tajne genoma Ana Tomašić Paić 1 *, Miroslav Poznić 2, Snježana Jurić 1, Hrvoje Fulgosi 1 1 Institut Ruđer Bošković, Zavod za molekularnu biologiju, Laboratorij za elektronsku mikroskopiju, P.P. 180, HR 10002, Zagreb, RH 2 Institut Ruđer Bošković, Zavod za molekularnu medicinu, Laboratorij za sistemsku biomedicinu, P.P. 180, HR 10002, Zagreb, RH *Autor za korespondenciju: Dipl. ing. Ana Tomašić Paić Ruđer Bošković Institute, Bijenička c. 54, P.O.Box 180, HR Zagreb, Croatia Tel.: / Fax: / address: Ana.Tomasic.Paic@irb.hr Pregledni rad UDK Prispjelo: lipanj Nedavna otkrića na području tehnologije DNA-čipova omogućuju znanstvenicima istraživanje ekspresije tisuća gena u jednoj jedinoj reakciji, pri čemu se stvara velika količina podataka. Biološki se čipovi temelje na metodi hibridizacije, te dozvoljavaju uvid u ekspresiju gena na razini čitavoga genoma. Štoviše, čipovi se upotrebljavaju kako bismo istražili stanične i signalne putove i osnovne aspekte rasta i razvoja organizma tj. biološke životne procese. Nedavno sekvencionirani genomi biljke Arabidopsis thaliana i čovjeka otkrivaju postojanje mnoštva gena uključenih u određene ljudske bolesti koji imaju svoje ortologe prisutne u višim biljkama. Ključni proteini uključeni u bolesti, a posebno njihovi načini ekspresije i principi nastalih mutacija, sve se više objašnjavaju primjenom čipova. Navedeni će tehnološki napredak, nadamo se, pridonijeti skorom otkriću podrijetla genetskih bolesti i ubrzati stvaranje specifičnih genskih terapija, a čemu ćemo barem malim djelićem pridonijeti i mi našim istraživanjima. Ključne riječi: genski čipovi, Affymetrix tehnologija, Arabidopsis thaliana, ljudske bolesti Uvod Tijekom proteklih nekoliko desetljeća informacijska tehnologija omogućuje revolucionarna otkrića na području biotehnoloških znanosti mikročipova. Razvoj tehnologije mikročipova uvelike pridonosi istraživanju genoma. Unatoč svojoj veličini, DNA mikročipovi imaju mogućnost pohranjivanja velike količine bioloških informacija i stoga su od velike važnosti za razvoj funkcionalne genomike, odnosno istraživanja funkcije gena. Informacije uklopljene unutar mikročipova sadrže točno određen slijed nukleotida ili građevnih blokova DNA koji čine genom nekog organizma. Grupa znanstvenika na čelu s dr. Stephenom P. A. Fodorom je 1990-tih godina razvila revolucionarnu ideju ujedinjenja tehnologije poluvodiča s naprednom tehnikom kombinatorijalne kemije u svrhu ugradnje velike količine bioloških podataka na malu staklenu ili plastičnu površinu čipa. Primjena mikročipova u laboratorijima ima svrhu istraživanja tisuća gena određenoga tkiva istovremeno, ispitivanjem ekspresijskoga profila cjelokupnoga genoma nekoga organizma. Svaki tip stanice ili tkiva karakterizira drugačiji model razine ekspresije gena te će proizvesti različite skupine proteina u vrlo specifičnim količinama. Ekspresija ili ispoljavanje gena je pojam koji opisuje prijepis (transkripciju) informacije sadržane u deoksiribonukleinskoj kiselini (DNA), skladištu genetske informacije, u mrna (glasnička molekula), odnosno u proteine (translacija) koji vrše većinu značajnih funkcija stanice. Proučavanjem količine nastalih transkripata u stanici utvrđuje se koji se geni prepisuju, čime se dobiva uvid u način na koji stanica odgovara na uvjete u okolišu poput klimatskih promjena, stresa i drugih nepovoljnih uvjeta. Mehanizam ekspresije gena djeluje kao on/off switch ili sklopka koja koordinira aktivnost gena u stanici, te prema potrebi povećava ili smanjuje razinu ekspresije pojedinačnoga gena (1). Na oligonukleotidne mikročipove nanosi se izolirani biološki materijal u obliku komplementarne ribonukleinske kiseline (crna) iz ispitivanoga i kontrolnoga uzorka iz kojih se mogu vrlo brzo detektirati aktivnosti tisuće prisutnih gena ili djelića genetskoga koda ispitivanoga genoma, te iščitati razlike u ispoljavanju pojedinačnih gena. Korištenjem odgovarajućega čitača (Affymetrix Scanner) dobivamo uvid u podatke koji se potom analiziraju primjenom suvremenih matematičkih algoritama. Svrha analize podataka jednim dijelom temelji se na razumijevanju odnosa gena i biološkoga značaja kodiranoga proteina te otkrivanja genetskih uzročnika bolesti i ispitivanja npr. uloge otpadne DNA. Dobiveni ekspresijski profili tisuća gena ukazuju na promjenu razine ekspresije gena genetički izmijenjenih ili oboljelih organizama u odnosu na nepromijenjeni ili zdravi genom. Mikročip tehnologija se također upotrebljava za identifikaciju heterozigota ili nekih drugih promjena u genomu primjenom platformi SNP-a (pojedinačni nukleotidni polimorfizmi). 253
2 Med Vjesn 2010; 42(3-4): Analiza glasničke RNA (mrna), odnosno nastalih transkripata organizma, predstavlja moćan alat u razumijevanju regulacije i funkcije gena. Primjena čipova postaje nezaobilazan dio genomskih, proteomskih i drugih istraživanja. Posljednjih godina pokrenuto je nekoliko velikih biotehnoloških projekata poput SAGE (serijska analiza ekspresije gena), MPSS-a (masivno paralelno označavanje sekvenciranjem) i DNA mikročipova (2). Mikročip eseji omogućuju paralelno ispitivanje i analiziranje mnoštva podataka, usporedbom tisuća gena ili genskih produkata na čipu. Analizu cjelokupnoga genoma moguće je provesti u jednoj jedinoj reakciji u tek nekoliko sati. Općeniti je trend u biomedicinskim istraživanjima upravo minijaturizacija konvencionalnih eseja (3), čime se smanjuje potreba za velikom potrošnjom reagenasa, povećava se koncentracija početnoga uzorka te ubrzava sama kinetika reakcije. Među čipovima najrašireniju primjenu na tržištu danas imaju Affymetrix GeneChip platforme, koje se odlikuju visokom reproducibilnošću rezultata i značajnim kapacitetom platformi visoke rezolucije. Među ostalim mikročipovima ističu se i oni proizvođača Agilent Technologies, Amersham Biosciences, NimbleGen Systems, Illumina, GE Healthcare, Applied Biosystems, Beckman Coulter, Eppendorf Biochip Systems. Prema potrebi mikročipove moguće je proizvesti i za specifične primjene u laboratorijima. Primjena čipova u medicini Genomika, kao znanstvena grana genetike, bavi se istraživanjem strukture i funkcije gena. Svoj procvat doživljava godine kada je dobiven uvid u cjelokupni genetski kod čovjeka, tzv. knjigu života. Međunarodni Human Genome projekt okupio je znanstvenike u suradnji s privatnom tvrtkom Celera Genomics kako bi sudjelovali u određivanju slijeda oko 30 tisuća gena ljudskoga organizma. Unatoč velikoj sličnosti ljudskog genoma unutar populacije, raznih etničkih ili dobnih skupina, utvrđena je rasprostranjenost brojnih varijacija u genetskom kodu. Varijacije se mogu povezivati s genetskim bolestima, kao što je iznimno rijetka Huntingtonova bolest, genetski poremećaj u središnjem živčanom sustavu, koji karakterizira progresivni motorički poremećaj, demencija i smrt. Huntington gen (HD), nađen na četvrtom kromosomu, sadrži CAG slijed kao dio sekvence, no kod oboljelih se broj dupliciranih tripleta ponavlja 40 do 120 puta, dok se kod šire populacije ponavlja do 26 puta. Primjenom čipa praćena je ekspresija približno šest tisuća gena u corpus striatumu, predjelu mozga posebno zahvaćenom bolešću, te je utvrđeno svega 2% gena čija je aktivnost u signalnom i neurotransmiterskom putu smanjena (4). Primjena čipova pridonosi razumijevanju mehanizama koji uzrokuju genetičke bolesti, što bi moglo rezultirati stvaranjem genetski oblikovanih tzv. inteligentnih lijekova, u nadi kako bi se svakoj oboljeloj osobi u budućnosti osigurao odgovarajući lijek. Čipovima dolazimo do novih spoznaja o specifičnim defektnim genima i njihovim promjenama u ispoljavanju uslijed izmijenjene regulacije i mogućih trigger faktora koji uzrokuju nastanak bolesti. GeneChip Human Genome U133A 2.0 (Slika 1.) sadrži dobro karakteriziranih gena čovjeka, a koristi se u istraživanjima procesa razvoja bolesti, odnosno ljudske biologije. Navedeni čip omogućuje analizu ekspresije transkripata i genetskih varijacija, te se sastoji od proba i oligonukleotidnih značajki. Čipovi u molekularnoj biologiji Revolucija primjene čipova u molekularnoj biologiji započela je godine uspješnim sekvenciranjem osnovnoga modelnog sustava, genoma biljke Arabidopsis thaliana, Talijinog uročnjaka, prikazanog na Slici 2. (Arabidopsis Genome Initiative). Ta biljka iz porodice Brassicaceae vrlo je pogodna za genetska istraživanja, jer ima najmanji genom među vaskularnim biljkama (125 Mbp), kratko generacijsko vrijeme, daje mnoštvo sjemenki, a cvjetovi se samooprašuju (5). Genom joj se sastoji od 5 kromosoma koji sadrže gena. Geni su udruženi i blisko raspoređeni (prosječno 4,6 kbp udaljeni) na kromosomima, što upućuje na kratke regulatorne regije prisutne u genomu biljaka u usporedbi sa životinjskim genomom. Određivanjem slijeda nukleotida genoma uročnjaka, otvorile su se neslućene mogućnosti utvrđivanja funkcije pojedinačnih gena ili skupine gena i njihove uloge u razvoju i životu biljke. Istraživanja također uključuju postupke uvođenja nasumičnih mutacija neposredno u DNA (kemijska mutageneza), zatim inserciju strane DNA (npr. transpozona ili T-DNA regije iz bakterije Agrobacterium tumefaciens) u genom transformirane biljke, također prikupljanje mutanata različitih fenotipa, izradu kromosomske mape mutiranih gena i uvođenje molekularnih markera u identifikaciji (6) ili oplemenjivanju sorti. Iako je genom uročnjaka sekvenciran godine, tek je 40% gena istraženo i njihova je funkcija poznata. Situacija je slična i za bakteriju E. coli, nematodu C. elegans, mušicu D. melanogaster te kvasac Saccharomyces cerevisiae (7). Istraživanjem Talijinoga uročnjaka (Arabidopsis thaliana) otkriveno je mnoštvo prototipova proteina ili proteinskih domena koji su također uključeni u razvoj ljudskih bolesti i druge aspekte biologije čovjeka. Postaje evidentno kako većina ljudskih gena za koje se sumnjalo ili pretpostavljalo da igraju važnu ulogu u procesima nastanka bolesti imaju svoje genske ekvivalente tj. ortologe (homologni geni koji dijele istu funkciju, a mogu se naći u vrlo različitim organizmima) u uročnjaku. Arabidopsis sadrži brojne gene slične onima koji uzrokuju ljudske bolesti, od raka do preranoga starenja te Wilsonove bolesti, kongenitalne kronične bolesti jetre uslijed abnormalnoga metabolizma bakra. Oko 70% gena koji su uključeni u razvoj raka kod ljudi imaju svoje srodne gene prisutne u uročnjaku, 67% ortologa prisutno je u vinskoj mušici Drosophila melanogaster, 72% ortologa u nematodi Caenorhabditis elegans, te 41% u kvascu Saccharomyces cerevisiae (8). Uočena sličnost funkcionalnih gena uključenih u različite stanične procese genoma čovjeka i njihova zastupljenost u drugim organizmima (Slika 3.), sugerira da su to stari i evolucijski očuvani proteini, čije se 254
3 Med Vjesn 2010; 42 (3-4): Slika 1. GeneChip Human Genome U133A 2.0 proizvođača Affymetrix Figure 1. GeneChip Human Genome U133A 2.0, made by Affymetrix SLIKA 2. Uzgoj biljke Arabidopsis thaliana Col-0 (L. Heynh.) u komori za uzgoj biljaka FIGURE 2. Plant Arabidopsis thaliana Col-0 (L. Heynh.) breeding in growth chamber podrijetlo može slijediti do zajedničkoga eukariotskog pretka (LECA, Last Eukaryotic Common Ancestor) od prije 1 do 2 milijarde godina. Štoviše, tijekom evolucije eukariota brojni funkcionalni geni (molekularni pomagači i proteini sličnih funkcija) višestruko su se duplicirali (paralozi), te postupkom horizontalnoga prijenosa gena (pseudoparalozi) prenosili iz bakterija u prve eukariote. Velik broj prisutnih paraloga i pseudoparaloga rezultat je evolucijske razmjene gena, što je utvrđeno komparativnom analizom genoma, te se smatraju osnovnim biljezima prilikom utvrđivanja podrijetla eukariota (9). Uslijed izlaganja biljaka infekcijama različitim patogenima poput bakterija, virusa, nematoda, te insekata prisutnih u okolišu, biljke su razvile vrlo složeni mehanizam obrane. Biljke odgovaraju na navedene infekcije disease resistance genima čija aktivacija rezultira smanjenim rastom patogena te programiranom staničnom smrću (apoptoza) inficiranih stanica (poznatom kao hipersenzitivan odgovor, HR). Najpoznatija skupina disease resistance gena kodira proteine koji se sastoje od središnjega nukleotidno-vezujućeg mjesta (NB, nucleotid binding) i karboksi-terminalne regije bogate ponavljajućim slijedom leucina (LRR, leucine-rich repeat). Biljni NB-LRR proteini jesu primarni unutarstanični receptori biljnoga obrambenog sustava koje kodiraju disease resistance geni (10). Oko 150 ovih gena otkriveno je u uročnjaku, te je istraživana njihova uloga i u drugim cvjetnicama. Biljni NB- LRR proteini strukturalno i funkcionalno slični su NOD-u (nucleotide-binding oligodimerization domain) - LRR porodici proteina otkrivenoj u sisavaca, zvanih CATERPILLAR proteinima, također uključenim u upalne procese i imuni odgovor. Ljudski NOD protein-aktivirajući faktor 1 apoptozne proteaze (APAF-1) posjeduje NB (nucleotide binding) domenu uz veliku homologiju proteinskoga slijeda s biljnim NB-LRR proteinima (8). Ekvivalenti ljudskim ortolognim i paralognim (homologni geni nastali duplikacijom gena u istoj vrsti, no nemaju istu funkcionalnu ulogu) genima u imunološkom sustavu životinja su geni različitih naziva: NOD/CARD/ CATERPILLAR (11). Štoviše, genetske varijacije u NOD2 i CIITA (major histocompatibility complex, MHC razred II transaktivatora) u ljudi i Naip 5 (inhibitorni protein neuronske apoptoze) u miševa, povezani su s upalnim bolestima, 255
4 Med Vjesn 2010; 42(3-4): SLIKA 3. Funkcionalna raznovrsnost ljudskih gena vrlo je slična i u drugim vrstama FIGURE 3. The functional diversity of human genes is shared by other species odnosno povećanom osjetljivošću na bakterijske infekcije. Pretpostavlja se da su NOD2 proteini sisavaca citosolni senzori koji induciraju apoptozu, te sudjeluju u regulaciji upalnih procesa. Biljni NB-LRR proteini se povezuju s molekularnim pomagačima HSP90 i SGT1 koji su uključeni u imunološki odgovor. Posljedično je otkriveno kako citosolni HSP90 i SGT1 ortologni geni u životinja kontroliraju funkciju NOD/CATERPILLAR proteina prisutnih u njihovom imunološkom sustavu. Prvi ljudski NOD gen (CIITA) izoliran je godine i pokazuje sličnost s NB-LRR biljnim disease resistance genima (11), te je upravo NOD2, gen homolog biljnoga NB-LRR, prvi gen kandidat za istraživanje Kronove bolesti, rijetkoga upalnog poremećaja tankoga crijeva (8). Činjenica je kako bolesti proizlaze uslijed određenih promjena u aktivnosti proteina u osnovnim staničnim procesima, uslijed mutacija, genetskih varijacija odnosno aberacija na kromosomima. Poznavanje funkcije pojedinačnih gena biljke uročnjaka može pomoći u razumijevanju uloge srodnih gena uključenih u kompleksne molekularne putove i procese u čovjeku, te pridonijeti istraživanju uzroka bolesti i mehanizama nastanka bolesti. Affymetrix tehnologija Razvoj tehnologije mikročipova i njihova biološka primjena u okviru molekularnih znanosti temelji se na postojećim industrijskim principima izrade poluvodiča. Umjesto urezivanja minijaturnih električnih sklopova, oligonukleotidnimikročipovi sadrže milijune odsječaka nukleinskih kiselina i drugih biopolimera ili biokemijskih građevnih blokova utisnutih na čip (12). ATH1 GeneChip (patentirani nosač američkoga proizvođača Affymetrix) sustav je platforme za analizu transkripcijske aktivnosti gena prisutnih u genomu modelnoga organizma Arabidopsis thaliana. ATH1 Arabidopsis GeneChip konstruiran je u suradnji s TIGR-om (The Institute for Genomic Research), a sadrži više od probnih grupa koje predstavljaju približno sekvenci gena (13). Rezultati analize kompletnoga nukleotidnog slijeda genoma Arabidopsisa pružaju nam uvid u organizaciju genoma i genskog sadržaja te omogućuju karakterizaciju i identifikaciju gena u svrhu istraživanja njihove strukture i funkcije. ATH1 biološki mikročipovi temeljeni na informacijama dobivenim sekvenciranjem, primjenjuju se upravo u svrhu istraživanja regulacije gena uključenih u proces fotosinteze i mnoge druge fiziološke i metaboličke procese regulirane unutrašnjim i okolišnim čimbenicima. Affymetrix GeneChip Instrument System (Affymetrix, High Wycombe, UK) sustav je koji se (Slika 4.) sastoji od Affymetrix radne jedinice, hibridizacijske peći (GeneChip Hybridization Oven 640), ispiralice (Affymetrix GeneChip Fluidics Station 450), čitača (Affymetrix GCS3000 7G 256
5 Med Vjesn 2010; 42 (3-4): SLIKA 4. Sustav platforme Affymetrixa FIGURE 4. Affymetrix platform system SLIKA 5. Hibridizirane probe čipa FIGURE 5. Hybridized chip probes GeneChip Scanner) i programa za analizu podataka (Affymetrix GCOS v1.2 system software and Data Mining Tool 3.0). Affymetrix genski čip Genski čip je mali nosač, odnosno pločica na koju su vezani kratki odsječci jednolančane DNA (sintetički oligonukleotidi), odnosno DNA fragmenti koji su robotiziranim sustavima utisnuti u velikom broju malih točaka visoke gustoće. U svakoj se točki na mikročipu nalaze oligonukleotidne probe poznatih slijedova nukelotida, dugačke 25 do 30 baza koje su imobilizirane na čipu in situ fotolitografskom sintezom (Slika 5.). Nukleotidi se dodaju rastućem lancu u svakom novom krugu sinteze, dok nije postignuta odgovarajuća duljina oligonukleotidnoga lanca. Ukoliko se na površinu cdna (komplementarna DNA) mikročipova utiskuju cdna molekule, prethodno su umnožene lančanom reakcijom polimerazom i pročišćene, te se u vrlo malim količinama nanose na pripadajuće mjesto (feature) na čipu tehnologijom mehaničkoga utiskivanja (microspotting) ili mlaznoga tiskanja (ink jetting). Iako je tehnika fotolitografije daleko naprednija od mikroinjektiranja obzirom na gustoću utisnutih točaka na čipu, u budućnosti se očekuje proizvodnja cdna čipova koji će sadržavati i do točaka na površini čipa od ~6,5 cm 2. Materijal koji hibridizira na čipu (array) je crna (komplementarna RNA) koja predstavlja uzorak, odnosno target. In vitro transkripcijom crna je sintetizirana iz cdna (komplementarne DNA) molekule, te je naknadno obilježena biotinom i obojana fluorescentnom bojom s konjugiranim streptavidinom. Tako pripremljena crna hibridizira s oligonukleotidnim probama na čipu prema načelu komplementarnosti baza. Nastale hibridizacijske točke jednostavno se detektiraju i kvantificiraju odgovarajućim čitačem i obrađuju pripadnim programskim algoritmima. Svaki ciljni transkript, odnosno gen predstavljen je s dvije oligonukleotidne probe (probe pair). Jedna je proba predstavljena ispravnom sekvencom dijela gena pri čemu dolazi do pravilnoga ili referentnoga sparivanja (PM, perfect match), a druga sekvenca vodi nepravilnom (MM, mismatch) sparivanju nukleotida (Slika 6.). Razlika između MM i PM proba je u jednom nukleotidu u sredini MM probe (13. nukleotid). Svaki skup proba (probe set) sadrži parova oligonukleotidnih proba, odnosno različitih dijelova gena početnoga, središnjega i završnoga dijela sekvence (5 i 3 dio gena). Svrha različitosti proba je u utvrđivanju nespecifičnoga vezanja, pozadinskih šumova i u kontroli vjerodostojnosti signala. Vrijednost razine ekspresije svakoga pojedinačnog 257
6 Med Vjesn 2010; 42(3-4): SLIKA 6. Probni par i probni skup gena FIGURE 6. Gene probe pair and probe set gena predstavljena je prosječnom razlikom PM i MM proba zajedno sintetiziranih na čipu (14). Prosječna površina čipa od 1,6384 cm 2 i površina pojedinačne točke na čipu od 4,096 x 10-6 cm 2, omogućuje ugradnju oko različitih komplementarnih proba, odnosno milijune kopija specifičnih oligonukleotidnih lanaca gena. Oligonukleotidi se usidruju na 3 kraju proba čime se povećava vjerojatnost hibridizacije s jednolančanom nukleinskom kiselinom. Hibridizacija fluorescentno obilježene crna i proba na čipu detektira se očitanjem površine čipa laserskim čitačem. Intenzitet zabilježenoga signala u boji raste od crne, plave, zelene, žute, narančaste, crvene do bijele boje. Upravo crvena i bijela boja ukazuju na veliku količinu prisutnih transkripata u uzorku. Nakon što platforma skenira fluorescencijski signal s čipova, slijedi analiza slika (.DAT file). Fluorescencijski signal rezultat je uspješne hibridizacije oligonukleotidnih proba s obilježenom komplementarnom RNA (crna). Stoga signal reflektira vrijednost ekspresije gena određenoga uzorka, obzirom da je proporcionalan prisutnoj količini transkripata. Transkript se smatra prisutnim u ispitivanom uzorku u odnosu na kontrolni uzorak ukoliko je razlika signalnih intenziteta PM i MM proba statistički značajno iznad vrijednosti pozadinskih ili background signala. Ekspresijske vrijednosti pojedinačnoga gena utvrđuju se na osnovi sakupljenih informacija skupa PM/MM proba pomoću Affymetrix GeneChip Operating Software-a (GCOS). Navedeni program koristi statističke algoritme (Statistical Expression Algorithm) u svrhu izračunavanja kvalitativnih (absent/present) i kvantitativnih (signal) vrijednosti signalnoga intenziteta pojedinačnoga transkripta. GCOS je produkt kombinacije programa Micro Array Suite (MAS) i Micro DB ujedinjenih u program za automatsku analizu intenziteta prisutnih točaka (pixels) na čipu. Mikročip tehnologija generira velike količine kompleksnih podataka koji se pohranjuju u odgovarajućim bazama podataka (Gene Expression Omnibus, Array Express). Pohranjivanju podataka prethodi složena analiza desetaka tisuća gena primjenom različitih akademskih ili komercijalno dostupnih računalnih programa, poput GeneSpring (Silicon Genetics), Microarray Suite i Data Mining Tool (Affymetrix). Kod višestrukih mjerenja razine transkripata mikročipovima pojavljuju se sistemske razlike među čipovima koje se moraju normalizirati prije integriranja podataka u pojedinačne analize. Prema Bolstadtu (15), normalizacija na kvantile predstavlja najprihvatljiviju metodu normalizacije skupova podataka mikročipova, kojom se izjednačava raspodjela ekspresijskih vrijednosti svih uzoraka eksperimenta. Odabir statistički dostupne metode u svrhu identificiranja diferencijalno eksprimiranih gena između dva različita stanja, ispitivanoga i kontrolnoga, može značajno utjecati na konačan zaključak (16). Stoga je izuzetno važno unaprijed ustanoviti koja je metoda najbolja za analizu bioloških podataka. Nakon analize slijedi interpretacija podataka, odnosno sustavno povezivanje u smislenu cjelinu ili biološki značaj. Geni kod kojih je došlo do promjene ekspresijskoga profila (diferencijalno eksprimirani geni) svrstavaju se u skupine gena sličnih ekspresijskih profila primjenom tzv. clustering (klastering) metode. Odgovarajućim statističkim pristupom poput hijerarhijskoga ili K-means klasteriranja geni se povezuju u klastere. Tako možemo identificirati i promjene u ekspresiji gena koji su uključeni u isti metabolički ili signalni put. Zaključci Velike prednosti tehnologije bioloških čipova, odnosno DNA mikročipova u otkrivanju svojstava genoma leže u mogućnostima paralelnih analiza ekspresijskih profila tisuća gena specifičnom hibridizacijom. Time se dobiva uvid u međusobnu interakciju pojedinačnih gena unutar stanice uz razumijevanje regulatornih mehanizama njihovih signalnih i biokemijskih putova. Stoga se čipovi primjenjuju u istraživanjima specifičnih i rijetkih oboljenja (dijagnostika) u svrhu utvrđivanja genetskih varijacija i predispozicija na bolesti. Također, primjena čipova izražena je i u poljoprivrednoj i prehrambenoj znanosti. Budući aspekti primjene čipova uključuju gensku terapiju, a samim time i razvoj farmakogenomike ili biološki aktivnih lijekova. 258
7 Med Vjesn 2010; 42 (3-4): Razvoj nanotehnologije, bioinženjerstva i neuroznanosti pridonijet će povezivanju znanja i dostignuća sa zajedničkim ciljem stvaranja poluvodičkih nano čipova s mogućnošću implantiranja u ljudski mozak. Takvi bi čipovi mogli djelovati kao osjetila i pobuđivači, mogli bi vratiti vid slijepima, onima slabije memorije pomoći u razvijanju sjećanja i učenju jezika, te svakom pojedincu otvoriti put enciklopedijskim bazama podataka. Kao osjetilni pojačivači mogli bi pojačati doseg naših osjetila u promatranju ultravioletne i infracrvene svjetlosti, u mentalnoj komunikaciji s drugim pojedincima (cyberthink), čime bi se unaprijedila kvaliteta života i poslovanja (17). Unatoč primjeni DNA mikročipova u svrhu liječenja i sprječavanja bolesti poput multiple skleroze, dijabetesa i kardiovaskularnih bolesti, te u znanstvene svrhe, otvaraju se i brojna etička pitanja vezana uz spoznaju o individualnim genetskim osobinama pojedinaca i njihovom značaju za društvene sredine. Iako oštećeni geni ne moraju nužno značiti da će osoba oboljeti od neke bolesti, ona ipak pokazuje veću predispoziciju na pojavnost bolesti što može rezultirati obilježavanju takve osobe kao društveno neprihvaćene individue. Zabilježeni slučajevi u SAD-u govore kako neke velike tvrtke traže uvid u genetske mape prilikom zapošljavanja i zdravstvenoga osiguravanja zaposlenika. To pokazuje nužnost razvoja pravnoga okvira u skladu s razvojem tehnologije, a s ciljem zaštite slobode i digniteta kako pojedinaca, tako i cijele populacije. Potencijalne revolucionarne implikacije poluvodičkih čipova i mikročipova zahtijevaju otvoren multidisciplinaran dijalog i temeljitu procjenu u svrhu internacionalnoga razmatranja etičkoga pitanja razumne primjene čipova u budućnosti. Uostalom, što su izazovi veći, veća je i naša odgovornost, i to ne samo znanstvenika i istraživača, nego i društva općenito. 10. Jones JDG, Dangl JL. The plant immune system. Nature. 2006;444: Ting JPY, Kastner DL, Hoffman HM. Caterpillers, pyrin and hereditery immunological disorders. Nat Rev Immunol. 2006;6: Lockhart DJ, Dong H, Byrne MC, Follettie MT, Gallo MV, Chee MS, i sur. Expression monitoring by hybridization to high-density oligonucleotide arrays. Nat Biotechnol. 1996;14: Redman JC, Haas BJ, Tanimoto G, Town CD. Development and evaluation of an Arabidopsis whole genome Affymetrix probe array. Plant J. 2004;38: Draghici S. Statistical intelligence: effective analysis of high-density microarray data. Drug Discov Today. 2002;7: Bolstadt B, Irizarry R, Astrand M, Speed T. A comparison of normalization methods for high density oligonucleotide array data based on variance and bias. Bioinformatics. 2003;19: Jeffery IB, Higgins DG, Culhane AC. Comparison and evaluation of methods for generating differentially expressed gene lists from microarray data. Bioinformatics. 2006;7: h ttp://www. l a h e y. o rg / N e w s P u b s / P u b l i c a tions/ethics/ JournalWinter2001/Journal_Winter2001_Feature.asp Literatura Pollock JD. Gene expression profiling: methodological challenges, results, and prospects for addiction research. Chem Phys Lipids. 2002;121: Fodor SPA. Massively parallel genomics. Science. 1997;277: Luthi-Carter R, Strand A, Peters NL, Solano SM, Hollingsworth ZR, Menon AS, i sur. Decreased expression of striatal signaling genes in a mouse model of Huntington s disease. Hum Mol Genet. 2000;9: Meinke DW, Cherry JM, Dean C, Rounsley SD, Koornneef M. Arabidopsis thaliana: a model plant for genome analysis. Science. 1998;282: Koncz C, Németh K, Rédei GP, Schell J. T-DNA insertional mutagenesis in Arabidopsis. Plant Mol Biol. 1992;5: Michelmore R, Burtis K, Gusfield D. The UC Davies genomics initiative. Technical report. University of California, Davis; Dostupno na adresi: 8. Jones AM, Chory J, Dangl JL, Estelle M, Jacobsen SE, Meyerowitz EM, i sur. The impact of Arabidopsis on human health: diversifying our portfolio. Cell. 2008;133: Makarova KS, Wolf YI, Mekhedov SL, Mirkin BG, Koonin EV. Ancestral paralogs and pseudoparalogs and their role in the emergence of the eukaryotic cell. Nucleic Acids Res. 2005;33:
8 Med Vjesn 2010; 42(3-4): Biological chips unlock the secrets of genome Ana Tomašić Paić 1 *, Miroslav Poznić 2, Snježana Jurić 1, Hrvoje Fulgosi 1 1 Rudjer Bošković Institute, Division of Molecular Biology, Laboratory for Electron Microscopy, P. O. Box. 180, HR 10002, Zagreb, Croatia 2 Rudjer Bošković Institute, Division of Molecular Medicine, Laboratory for Systems Biomedicine, P. O. Box. 180, HR 10002, Zagreb, Croatia *Corresponding author: Dipl. ing. Ana Tomašić Paić Ruđer Bošković Institute, Bijenička c. 54, P.O.Box 180, HR Zagreb, Croatia Tel.: / Fax: / address: Ana.Tomasic.Paic@irb.hr Review Abstract Recent advances in microarray technology allowed scientists to investigate expression of thousands of genes in a single reaction, thus generating a vast amount of data. Biological chips, based on hybridization methods, enable detection of genes on a genomic scale. Moreover, chips are used to elucidate fundamental life processes such as cellular and signalling pathways and basic aspects of growth and development of organisms. Recently sequenced model plant Arabidopsis thaliana and human genome revealed that a majority of human genes involved directly or indirectly in certain human diseases have their orthologs in vacular plants. Determination of key proteins involved in human health and disease, especially their gene expression patterns and mutations, are becoming rapidly examined and investigated by using biological chips. These technological advances will hopefully uncover the origin of genetic illnesses and likely lead to creation of specific gene therapies. Key words: gene chips, Affymetrix technology, Arabidopsis thaliana, human diseases 260
SVEUČILIŠTE U ZAGREBU PRIRODOSLOVNO-MATEMATIČKI FAKULTET BIOLOŠKI ODSJEK ALTERNATIVNO IZREZIVANJE INTRONA U BILJAKA ALTERNATIVE SPLICING IN HIGHER PLA
SVEUČILIŠTE U ZAGREBU PRIRODOSLOVNO-MATEMATIČKI FAKULTET BIOLOŠKI ODSJEK ALTERNATIVNO IZREZIVANJE INTRONA U BILJAKA ALTERNATIVE SPLICING IN HIGHER PLANTS SEMINARSKI RAD Vanja Tadić Preddiplomski studij
ВишеStruktura i funkcija nukleinskih kiselina
Struktura i funkcija nukleinskih kiselina MOLEKULARNA OSNOVA NASLJEDNOSTI Vaša boja kose, visina, krvna grupa i sposobnost da metabolizirate hranjive materije su sve nasljedne osobine. Ove karakteristike
ВишеUpala pluća – koji su faktori rizika i uzročnici, liječenje
Kreni zdravo! Stranica o zdravim navikama i uravnoteženom životu https://www.krenizdravo.rtl.hr Upala pluća - koji su faktori rizika i uzročnici, liječenje Upala pluća jedan je od vodećih uzroka oboljenja
ВишеDetaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: METODE U DNA TEHNOLOGIJAMA Akademska godina: 2018/2019 Studij: diplomski studij Istraživanje i razvoj i l
Detaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: METODE U DNA TEHNOLOGIJAMA Akademska godina: 2018/2019 Studij: diplomski studij Istraživanje i razvoj i lijekova diplomski studij Biotehnologija u medicini
ВишеMicrosoft PowerPoint - Bazdaric_vrste istrazivanja 2014_ pptx [Read-Only]
Sveučilišni diplomski studij medicinsko-laboratorijske dijagnostike Kolegij: Medicinska informatika u kliničko-laboratorijskoj dijagnostici (MIKLD 2014./15.) Vrste istraživanja Biomedicinska istraživanja
ВишеNAUČNO-NASTAVNOM VEĆU
НАУЧНО-НАСТАВНОМ ВЕЋУ МЕДИЦИНСКОГ ФАКУЛТЕТА У КРАГУЈЕВЦУ Комисија за припрему извештаја у саставу: 1. Проф. др Слободан Јанковић редовни професор Медицинског факултета у Крагујевцу, 2. Проф. др Милица
ВишеPowerPoint Presentation
Показатељи технолошког напретка Технолошки развој Резултира стварањем нових или побољшањем постојећих производа, процеса и услуга. Технолошки развој - део економског и друштвеног развоја. Научни и технолошки
ВишеGENETSKI TREND PRINOSA MLEKA I MLEČNE MASTI U PROGENOM TESTU BIKOVA ZA VEŠTAČKO OSEMENJAVANJE
IV SEMINAR ODGAJIVAČKIH ORGANIZACIJA U STOČARSTVU REPUBLIKE SRBIJE HOTEL ĐERDAP TURIST 01.- 04. April 2018. Procena oplemenjivačkih vrednosti u stočarstvu ES( G) h 2 i L r IH Prof. dr Snežana Trivunović,
ВишеOBRAZAC
PRILOG III Popunjava Ministarstvo DATUM PRIJAVE: KLASA: URBROJ: Broj prijave u jedinstvenom upisniku GMO-a: Broj prijave u posebnom upisniku GMO-a: PRIJAVA ZA DOBIVANJE DOPUŠTENJA ZA NAMJERNO UVOĐENJE
ВишеSVEUČILIŠTE U ZAGREBU PRIRODOSLOVNO-MATEMATIČKI FAKULTET BIOLOŠKI ODSJEK MOLEKULARNE METODE U KLASIFIKACIJI BAKTERIJA MOLECULAR METODS IN BACTERIAL CL
SVEUČILIŠTE U ZAGREBU PRIRODOSLOVNO-MATEMATIČKI FAKULTET BIOLOŠKI ODSJEK MOLEKULARNE METODE U KLASIFIKACIJI BAKTERIJA MOLECULAR METODS IN BACTERIAL CLASSIFICATION Tajana Majić Preddiplomski studij molekularne
ВишеКОНКУРС
На основу члана 98. Закона о високом образовању ( Службени гласник РС, број 88/17), члана 85. Статута Универзитета у Београду ( Гласник Универзитета у Београду, број 201/18 и 207/19), и Одлуке Сената о
ВишеMAZALICA DUŠKA.pdf
SVEUČILIŠTE JOSIPA JURJA STROSSMAYERA U OSIJEKU ELEKTROTEHNIČKI FAKULTET Sveučilišni studij OPTIMIRANJE INTEGRACIJE MALIH ELEKTRANA U DISTRIBUCIJSKU MREŽU Diplomski rad Duška Mazalica Osijek, 2014. SADRŽAJ
ВишеU proračunu Europske unije za Hrvatsku je ukupno namijenjeno 3,568 milijardi Eura za prve dvije godine članstva
Copernicus Općenito o programu: Program Copernicus, koji je u prijašnjem programskom razdoblju bio poznat pod nazivom GMES (Globalni nadzor za zaštitu okoliša i sigurnost), europski je program namijenjen
ВишеVirusi
Najniži stupanj organizacije živih sistema Metabolički inertni van žive ćelije Acelularni organizmi - obligatni intracelularni paraziti (koriste raspoložive enzime i strukture žive ćelije) Veličina: 20-300
ВишеPREDUVJETI ZA UPIS I POLAGANJE POJEDINIH PREDMETA AK. GOD /2017. PREDDIPLOMSKI SVEUČILIŠNI STUDIJ Preddiplomski sveučilišni studij KEMIJA Za upi
PREDUVJETI ZA UPIS I POLAGANJE POJEDINIH PREDMETA AK. GOD. 2016./2017. PREDDIPLOMSKI SVEUČILIŠNI STUDIJ Preddiplomski sveučilišni studij KEMIJA Za upis nekog od predmeta III. potrebno je položiti sve predmete
ВишеAKTUALNI EU NATJEČAJI
AKTUALNI EU NATJEČAJI 29.07.2019. Sav sadržaj objavljen u om dokumentu je zaštićen autorskim pravom i/ili relevantnim zakonima o zaštiti žiga. Sadržaj Sadržaj... 2 1. OBZOR 2020... 3 2. NOVO! EIC Accelerator
ВишеSEN - nastava iz predmeta
SVEUČILIŠTE U ZAGREBU MEDICINSKI FAKULTET Studij: BIOMEDICINA I ZDRAVSTVO Izvedbeni nastavni plan predmeta Eksperimentalna onkologija: zloćudne bolesti kao stanje trajnog oksidacijskog stresa Akademska
ВишеMicrosoft PowerPoint - Pokazatelji TP i stopa TP_ za studente [Compatibility Mode]
Показатељи технолошког напретка Технолошки развој Резултира стварањем новихили побољшањем постојећихпроизвода, процеса и услуга. Технолошки развој - део економског и друштвеног развоја. Научни и технолошки
ВишеNASTAVNI PLAN I PROGRAM STUDIJSKOG PROGRAMA 2: LABORATORIJSKE TEHNOLOGIJE ZA ZVANJE: BACHELOR LABORATORIJSKIH TEHNOLOGIJA 8
NASTAVNI PLAN I PROGRAM STUDIJSKOG PROGRAMA 2: LABORATORIJSKE TEHNOLOGIJE ZA ZVANJE: BACHELOR LABORATORIJSKIH TEHNOLOGIJA 8 Studij laboratorijskih tehnologija obrazuje kompetentni kadar za rad u laboratorijama
ВишеNalaz urina – čitanje nalaza urinokulture
Kreni zdravo! Stranica o zdravim navikama i uravnoteženom životu https://www.krenizdravo.rtl.hr Nalaz urina - čitanje nalaza urinokulture Urinokultura ili biokemijska analiza mokraće jedna je od osnovnih
ВишеTvrtka prijatelj zdravlja Sadržaj publikacije isključiva je odgovornost Hrvatskog zavoda za javno zdravstvo. Korisnik: Hrvats
Tvrtka prijatelj zdravlja www.strukturnifondovi.hr Sadržaj publikacije isključiva je odgovornost Hrvatskog zavoda za javno zdravstvo. Korisnik: Hrvatski zavod za javno zdravstvo / Ukupan iznos projekta:
ВишеŠkolsko natjecanje, 1.r.,2011
REPUBLIKA HRVATSKA ŠKOLSKO NATJECANJE IZ BIOLOGIJE 0. 3. skupina (. razred gimnazije) Ukupan broj bodova: Zaporka natjecatelja: Broj postignutih bodova: Postotak riješenosti testa: Potpisi članova povjerenstva:..
ВишеAM_Ple_NonLegReport
9.2.2017 A8-0005/9 Amandman 9 Stavak 1.a (novi) 1 a. poziva Komisiju da predloži sljedeće zajedničke europske definicije: umjetna inteligencija je automatizirani sustav s mogućnošću simulacije nekih ljudskih
ВишеPodružnica za građenje
Dodatak A OPIS USLUGA DODATAK A-1 PROJEKTNI ZADATAK Revizija scenarija i algoritama Regionalnih centara za nadzor i upravljanje prometom na autocestama Zagreb, srpanj 2019. 1. Uvod Sve veći porast prometa
ВишеPrenatalna dijagnostika Doc.dr.sc. Maja Barbalić Prenatalna dijagnostika podrazumijeva provođenje različitih postupaka, neinvazivnih i invazivnih, koj
Prenatalna dijagnostika Doc.dr.sc. Maja Barbalić Prenatalna dijagnostika podrazumijeva provođenje različitih postupaka, neinvazivnih i invazivnih, kojima se može odrediti zdravstveno stanje ploda tijekom
ВишеANALIZE MASENOM SPEKTROMETRIJOM SEKUNDARNIH MOLEKULARNIH IONA ZA PRIMJENE U FORENZICI
ANALIZE MASENOM SPEKTROMETRIJOM SEKUNDARNIH MOLEKULARNIH IONA ZA PRIMJENE U FORENZICI Marko Crnac Fizički odsjek, PMF Mentor: dr. sc. Iva Bogdanović Radović Laboratorij za interakcije ionskih snopova Institut
ВишеDetaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: Biokemija Akademska godina: 2018/2019 Studij: Preddiplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživa
Detaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: Biokemija Akademska godina: 08/09 Studij: Preddiplomski sveučilišni studij Biotehnologija i istraživanje lijekova Kod kolegija: BIL 0 ECTS bodovi: Jezik na
ВишеPROKARIOTI I EUKARIOTI
PROKARIOTI I EUKARIOTI https://www.shmoop.com/biology-cells/prokaryotic-cells.html Sve stanice su izgrađene od istih tipova organskih molekula 1. Nukleinske kiseline (mononukleotidi, polinukleotidi, adenozin-trifosfat)
ВишеSeminar Novi zakonodavni okvir za elektroenergetski sektor
Seminar TRŽIŠTE ELEKTRIČNE ENERGIJE NA RAZINI DISTRIBUCIJSKOG SUSTAVA ULOGA OPERATORA DISTRIBUCIJSKOG SUSTAVA NA TRŽIŠTU ELEKTRIČNE ENERGIJE, mag.ing.el. HEP-Operator distribucijskog sustava d.o.o. Zagreb,
ВишеPostojanost boja
Korištenje distribucije osvjetljenja za ostvaranje brzih i točnih metode za postojanost boja Nikola Banić 26. rujna 2014. Sadržaj Postojanost boja Ubrzavanje lokalnog podešavanja boja Distribucija najčešćih
ВишеPodaci i znanje o nanomaterijalima- Obrada društveno važnih znanstvenih činjenica Baza znanja Nanomaterijali Zadnji rezultati ist
Podaci i znanje o nanomaterijalima- Obrada društveno važnih znanstvenih činjenica Baza znanja Nanomaterijali Zadnji rezultati istraživanja o učincima nanomaterijala na ljude i okoliš Znanstveno utemeljeni
Вишеbiologija 8 razred -nasljedivanje i kako nastajemo
BIOLOGIJA Srodnost-razlicite vrste koje imaju mnogo zajednickih svojstva Za vrste koje nisu srodne, ali po nekim svojstvima nalikuju jedna na drugu kazemo da su slicne. Raznolikost se uocava vec unutar
ВишеPriredila: dr Nora Lazar Šarnjai
Priredila: dr Nora Lazar Šarnjai Šećerna bolest je trajno stanje, a poremećaji u metabolizmu ugljenih hidrata, masti i belančevina udruženi su sa oštećenjem i disfunkcijom brojnih organa i sistema, posebno
ВишеKBC - MALDI TOF BROSURA A5 - Logotipi prednja.indd
INFORMIRANJE O PROJEKTU Pro Europska unija +385 (0) 31 511 655 ravnateljstvo@kbco.hr Zajedno do fondova EU www.clinical-maldi-tof.eucal-maldi-tof.eu rala Europska unija iz Europskog fonda za regionalni
ВишеBROSURA nn
Preventivni program Za zdravlje. Danas. Nacionalni program ranog otkrivanja raka debelog crijeva Izdavač: Ministarstvo zdravlja Republike Hrvatske Autori: Povjerenstvo za organizaciju, stručno praćenje
ВишеMože li učenje tablice množenja biti zabavno?
Mogu li besplatne igre na tabletima potaknuti učenike na učenje tablice množenja i dijeljenja? Sanja Loparić, prof. matematike i informatike Tehnička škola Čakovec Rovinj, 11.11.2016. Kad djeca nisu u
ВишеEUROPSKE REFERENTNE MREŽE POMOĆ PACIJENTIMA S RIJETKIM ILI KOMPLEKSNIM BOLESTIMA S NISKIM STUPNJEM RAŠIRENOSTI Share. Care. Cure. zdravlje
EUROPSKE REFERENTNE MREŽE POMOĆ PACIJENTIMA S RIJETKIM ILI KOMPLEKSNIM BOLESTIMA S NISKIM STUPNJEM RAŠIRENOSTI Share. Care. Cure. zdravlje ŠTO SU EUROPSKE REFERENTNE MREŽE? Europske referentne mreže (ERN)
ВишеEUROPSKE REFERENTNE MREŽE POMOĆ PACIJENTIMA S RIJETKIM ILI KOMPLEKSNIM BOLESTIMA S NISKIM STUPNJEM RAŠIRENOSTI Share. Care. Cure. zdravlje
EUROPSKE REFERENTNE MREŽE POMOĆ PACIJENTIMA S RIJETKIM ILI KOMPLEKSNIM BOLESTIMA S NISKIM STUPNJEM RAŠIRENOSTI Share. Care. Cure. zdravlje ŠTO SU EUROPSKE REFERENTNE MREŽE? Europske referentne mreže (ERN)
ВишеŠTA SU UROĐENI POREMEĆAJI METABOLIZMA BJELANČEVINA? Bjelančevine (proteini) su stalni sastojci naših prirodnih životnih namirnica. Tokom procesa varen
ŠTA SU UROĐENI POREMEĆAJI METABOLIZMA BJELANČEVINA? Bjelančevine (proteini) su stalni sastojci naših prirodnih životnih namirnica. Tokom procesa varenja, one se razgrađuju na svoje sastavne dijelove (aminokiseline)
ВишеMicrosoft PowerPoint - podatkovni promet za objavu.pptx
1 2 3 Što je složaj protokola (protocol suite)? Pojedini protokol se odnosi samo na jedno pitanje koje omogućava komunikaciju. Kada se kombinira više protokola, grupa protokola koja je rezultat takve kombinacije
ВишеNEŽELJENE REAKCIJE NA MLEKO
NEŽELJENE REAKCIJE NA MLEKO prof. dr Snežana Bulajić Katedra za higijenu i tehnologijunamirnica animalnog porekla NEŽELJENE REAKCIJE NA MLEKO 1. PREOSETLJIVOST (ALERGIJE) imunološki posredovane 2. AUTOIMUNE
ВишеFINANCIJSKI REZULTATI ZA GODINU Kontakt: INA-Industrija nafte, d.d. Sektor korporativnih komunikacija Avenija Većeslava Holjevca 10, Zagreb Služ
FINANCIJSKI REZULTATI ZA 2016. GODINU Kontakt: INA-Industrija nafte, d.d. Sektor korporativnih komunikacija, Zagreb Služba za odnose s javnošću E-mail: PR@ina.hr Press centar na www.ina.hr 1 INA u 2016.
ВишеUvod u obične diferencijalne jednadžbe Metoda separacije varijabli Obične diferencijalne jednadžbe Franka Miriam Brückler
Obične diferencijalne jednadžbe Franka Miriam Brückler Primjer Deriviranje po x je linearan operator d dx kojemu recimo kao domenu i kodomenu uzmemo (beskonačnodimenzionalni) vektorski prostor funkcija
ВишеPowerPoint Presentation
Anorganski reakcijski mehanizmi: klasifikacija Nino Jukić 14. svibnja 2019. Sadržaj Što je mehanizam? razvoj reakcijskih mehanizama kroz povijest (općenito i anorganska kemija) elementi glavnih skupina
ВишеУНИВЕРЗИТЕТ У БАЊОЈ ЛУЦИ ПОЉОПРИВРЕДНИ ФАКУЛТЕТ Катедра за хортикултуру Школска Предмет Шифра Студијски програм Циклус Година Семестар Број Број група
УНИВЕРЗИТЕТ У БАЊОЈ ЛУЦИ ПОЉОПРИВРЕДНИ ФАКУЛТЕТ Катедра за хортикултуру Школска Предмет Шифра Студијски програм Циклус Година Семестар Број Број група година предмета студената за вјежбе 2018/2019. Хортикултура
ВишеMicrosoft PowerPoint - KR-Aleric.ppt
Potreba za prekograničnom nom suradnjom na tržištu tu rada O nama Broj stanovnika - 4.437.460 Stopa zaposlenosti (15-64) 56,7% Stopa nezaposlenosti: Administrativni izvori 14,9% Anketa radne snage - 9,0%
ВишеMEHANIZAM DJELOVANJA ALKOHOL DEHIDROGENAZE
MEHANIZAM DJELOVANJA ALKOHOL DEHIDROGENAZE Viktorija Medvarić Skupina oksidoreduktaza (E.C. 1.1.1.1) Koenzim NAD(P)H Interkonverzija alkohola u aldehid/keton U arhejama, bakterijama i eukariotima Tip I,
ВишеMicrosoft Word - Plan rada KHH 2014.docx
KLUB HRVATSKIH HUMBOLDTOVACA Kroatischer Humboldtianer Klub Marulićev trg 19 10000 ZAGREB H r v a t s k a e-mail: khh@khh.humboldt-club.hr www.humboldt-club.hr STRATEŠKI PLAN RADA 2014.-2018. Klub hrvatskih
ВишеSlide 1
Анка Жилић, виша мед. сестра Малигне неоплазме представљају поремећај у расту ћелија, при чему долази до неконтролисаног раста ћелија неопластичног ткива, на штету домаћина. У настанку малигне ћелије разликују
ВишеMicrosoft PowerPoint - bergman
Prof.dr.sc.Biserka Bergman Marković Prof.dr.sc. Milica Katić Davorka Vrdoljak,dr.med. Ksenija Kranjčević,dr.med. Suzana Maltar Delija,dr.med. Valerija Bralić Lang,dr.med. Marija Klarić,dr.med. Data analysis:
ВишеAkademska godina: 2018/2019 Detaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: NANOMEDICINA Studij: Diplomski studij Biotehnologija u medicni Kod kolegija:
Akademska godina: 2018/2019 Detaljni izvedbeni nastavni plan za kolegij: NANOMEDICINA Studij: Diplomski studij Biotehnologija u medicni Kod kolegija: BUM102 ECTS bodovi: 5 Jezik na kojem se izvodi kolegij:
ВишеPBF
Prehrambeno inženjerstvo Ponedjeljak Utorak Srijeda Četvrtak 0.5-.00 Principi biotehnološke proizvodnje hrane 6 Prehrambeno-procesno 3.45-6.30.00-.45 Kemija i tehnologija mesa Prehrambeno-procesno Sustavi
ВишеNeuronske mreže
Neuronske mreže: Genetički algoritmi Prof. dr. sc. Sven Lončarić Fakultet elektrotehnike i računarstva sven.loncaric@fer.hr http://ipg.zesoi.fer.hr 1 Uvod U mnogim primjenama pojavljuje se problem optimizacije
ВишеMicrosoft PowerPoint - KJZ_P_zdribolest_dec2012
Zdravlje je stanje potpunog fizičkog, duševnog i socijalnog blagostanja, a ne samo odsustvo bolesti i iznemoglosti (Svjetska zdravstvena organizacija, 1948.) Doc. dr. sc. Ozren Polašek Katedra za javno
ВишеKorjenasto povrće – podjela, popis i dobrobiti
Kreni zdravo! Stranica o zdravim navikama i uravnoteženom životu https://www.krenizdravo.rtl.hr Korjenasto povrće - podjela, popis i dobrobiti Povrće je prijeko potrebno za kvalitetnu i uravnoteženu prehranu,
ВишеPowerPoint Presentation
Kompetencijski profil nastavnika u visokom obrazovanju Prof. dr. sc. Aleksandra Čižmešija Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno-matematički fakultet cizmesij@math.hr Educa T projekt Kompetencijski profil
Више4
4.1.2 Eksperimentalni rezultati Rezultati eksperimentalnog istraživanja obrađeni su u programu za digitalno uređivanje audio zapisa (Coll Edit). To je program koji omogućava široku obradu audio zapisa.
ВишеSlide 1
Strateški okvir za internacionalizaciju visokog obrazovanja i uloga regionalne suradnje 1 Erasmus je ključni financijski instrument za internacionalizaciju visokog obrazovanja. Važnost internacionalizacije
ВишеŠkola: Geodetska škola, Zagreb Razredni odijel: IV. D Datum: 22. studenog Školska godina: 2018./2019. Nastavnik: Katija Špika Mentor: Armando Sl
Škola: Geodetska škola, Zagreb Razredni odijel: IV. D Datum: 22. studenog 2018. Školska godina: 2018./2019. Nastavnik: Katija Špika Mentor: Armando Slaviček Priprema za nastavni sat Predmet : Prostorni
ВишеPowerPointova prezentacija
AKIS & I SIGURNOST HRANE U HRVATSKOJ Preliminarni rezultati Ovu prezentaciju je pripremio tim Grupacije Svjetske banke, kao prilog izradi Strategije razvoja poljoprivrede u Republici Hrvatskoj. Sadržaj
ВишеSTRATEGIJA URBANE SIGURNOSTI GRADA ZAGREBA
STRATEGIJA URBANE SIGURNOSTI GRADA ZAGREBA 2014. - 2017. - 2 - U V O D Urbana sigurnost pretpostavka je kvalitetnijeg života pojedinca u zajednici. Suvremeno društvo suočava se s mnogobrojnim sigurnosnim
ВишеClassroom Expectations
АТ-8: Терминирање производно-технолошких ентитета Проф. др Зоран Миљковић Садржај Пројектовање флексибилних ; Математички модел за оптимизацију флексибилних ; Генетички алгоритми у оптимизацији флексибилних
ВишеSustavi kotlovskih postrojenja
Sustavi kotlovskih postrojenja Teleservice Regulacija kotlova BCO BCO UL-S UNIVERSAL parni kotao WA Uređaj za analizu vode Kompetencija i povjerenje Bosch Industriekessel je u svjetskim razmjerima renomirani
ВишеMicrosoft PowerPoint - Prezentacija2
KARAKTERIZACIJA POVRŠINSKI AKTIVNIH TVARI AEROSOLA S URBANOG PODRUČJA ZAGREBA KORIŠTENJEM ELEKTROKEMIJSKIH METODA Sanja Frka a, Jelena Dautović a, Zlatica Kozarac a, Božena Ćosović a, Silvije Davila b
ВишеНаставно научном већу Хемијског факултета Универзитета у Београду На редовној седници Наставно-научног већа Хемијског факултета Универзитета у Београд
Наставно научном већу Хемијског факултета Универзитета у Београду На редовној седници Наставно-научног већа Хемијског факултета Универзитета у Београду одржаној 09.02.2017. године одређени смо за чланове
ВишеEvolucija gena (2.) (promene strukture i funkcije)
Evolucija gena (2.) (promene strukture i funkcije) Obrada genskih transkripata Većinsko prisustvo splajsozomskih introna u eukariotskim genima Npr. ljudski genom ima 88% gena sa intron-egzon strukturom
ВишеMaterijal i metode
Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno-matematički fakultet Biološki odsjek Ana Šimatović Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula Diplomski rad Zagreb,
ВишеMicrosoft PowerPoint - Basic_SIREN_Basic_H.pptx
Smart Integration of RENewables Regulacija frekvencije korištenjem mikromreža sa spremnicima energije i odzivom potrošnje Hrvoje Bašić Završna diseminacija projekta SIREN FER, 30. studenog 2018. Sadržaj
ВишеSlide 1
Катедра за управљање системима ТЕОРИЈА СИСТЕМА Предавањe 2: Основни појмови - систем, модел система, улаз и излаз UNIVERSITY OF BELGRADE FACULTY OF ORGANIZATIONAL SCIENCES План предавања 2018/2019. 1.
ВишеAvokado – čarobno voće
Kreni zdravo! Stranica o zdravim navikama i uravnoteženom životu https://www.krenizdravo.rtl.hr Avokado - čarobno voće Avokado je tropsko voće koje raste u Srednjoj Americi i Meksiku. Naziv avokado potječe
ВишеIskustva suradnje s tvrtkom iz perspektive istraživačke institucije
Iskustva suradnje s tvrtkom iz perspektive istraživačke institucije Zoran Kalafatić, FER Zagreb Financiranje projekta sufinanciranje HAMAG-BICRO kroz program IRCRO poticanje mikro, malih i srednjih poduzeća
ВишеMicrosoft Word - Smerovi 1996
ИСПИТНИ РОК: СЕПТЕМБАР 2018/2019 СТАРИ НАСТАВНИ ПЛАН И ПРОГРАМ (1996) Смер: СВИ Филозофија и социологија 20.08.2019 Теорија друштвеног развоја 20.08.2019 Програмирање 20.08.2019 Математика I 21.08.2019
ВишеnZEB in Croatia
EN-EFF New concept training for energy efficiency Termografsko snimanje Varaždin, 22.05.2018 Uvod IC termografija Infracrvena (IC) termografija je beskontaktna metoda mjerenja temperature i njezine raspodjele
ВишеGeometrija molekula
Geometrija molekula Oblik molekula predstavlja trodimenzionalni raspored atoma u okviru molekula. Geometrija molekula je veoma važan faktor koji određuje fizička i hemijska svojstva nekog jedinjenja, kao
ВишеBezmetalne i metal-keramičke krunice: Evo u čemu je razlika!
Kreni zdravo! Stranica o zdravim navikama i uravnoteženom životu https://www.krenizdravo.rtl.hr Bezmetalne i metal-keramičke krunice: Evo u čemu je razlika! Krunice, osim što nadoknađuju izgubljene zube,
ВишеMicrosoft Word - Predmet 14-Strategijski menadzment-rjesenja
КОМИСИЈА ЗА РАЧУНОВОДСТВО И РЕВИЗИЈУ БОСНЕ И ХЕРЦЕГОВИНЕ ИСПИТ ЗА СТИЦАЊЕ ПРОФЕСИОНАЛНОГ ЗВАЊА ОВЛАШТЕНИ РЕВИЗОР (ИСПИТНИ ТЕРМИН: МАЈ 2016. ГОДИНЕ) ПРЕДМЕТ 14: СТРАТЕГИЈСКИ МЕНАЏМЕНТ ЕСЕЈИ Есеј број 1
Више46th Croatian & 6th International Symposium on Agriculture
IZVORNI ZNANSTVENI RAD Smanjenje prinosa poljoprivrednih kultura u uvjetima bez navodnjavanja na području sjeveroistočne Bosne Univerzitet u Sarajevu, Poljoprivredno-prehrambeni fakultet, Zmaja od Bosne
ВишеUvod u statistiku
Uvod u statistiku Osnovni pojmovi Statistika nauka o podacima Uključuje prikupljanje, klasifikaciju, prikaz, obradu i interpretaciju podataka Staistička jedinica objekat kome se mjeri neko svojstvo. Svi
ВишеPRIMJER DOBRE PRAKSE SLOVENIJA: DARS d.d., Družba za avtoceste v Republiki Sloveniji Helena Pleslić, 20. studeni 2014 Zagreb
PRIMJER DOBRE PRAKSE SLOVENIJA: DARS d.d., Družba za avtoceste v Republiki Sloveniji Helena Pleslić, 20. studeni 2014 Zagreb DARS d.d. Glavni zadatki: Rad i održavanje autocesta u Sloveniji Nadzor i upravljanje
ВишеPowerPoint Presentation
+ Fakultet organizacionih nauka Upravljanje razvojem IS MSc Ana Pajić Simović ana.pajic@fon.bg.ac.rs ANALIZA POSLOVNIH PROCESA BUSINESS PROCESS MANAGEMENT (BPM) PROCESS MINING + Business Process Management
ВишеИзбор у звање научни сарадник кандидаткиња: Бојана Илић
1. Биографски подаци Место и година рођења: Приједор, 1984 Основне студије: Физички факултет Универзитета у Београду, завршила 2013.године просек: 10,00 Докторске студије: Физички факултет Универзитета
ВишеPridruživajuće kartiranje sastavnica eteričnog ulja ljekovite kadulje Jerko Gunjača Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet
Pridruživajuće kartiranje sastavnica eteričnog ulja ljekovite kadulje Jerko Gunjača Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet e-mail: jgunjaca@agr.hr HBMD, Zagreb, 18. studenog 2015. Pridruživajuće kartiranje
ВишеŽivi sustav u svemirskom vremenu i prostoru Od kvarka do stanice
Živi sustav u svemirskom vremenu i prostoru Od kvarka do stanice Veliki prasak i starost svemira Teorija velikog praska: Svemir se počeo širiti iz početnog vrlo gustog i neizmjerno vrućeg stanja. Starost
ВишеTransmissions in Vehicles
530577-TEMPUS-1-2012-1-RS-TEMPUS-JPCR IPROD: IMPROVEMENT OF PRODUCT DEVELOPMENT STUDIES IN SERBIA AND BOSNIA AND HERZEGOVINA Inovacioni menadžment - Uvod - Niš, jul 2015. Uvod 1. Značaj inovacije 2. Inovaciona
Више71-Segedi.indd
22. ljetna škola kineziologa republike hrvatske Ivan Segedi Davor Rožac Hrvoje Sertić Damir Labaš Prethodno znanstveno priopćenje MOTIVACIJA ZA BAVLJENJEM BUKYO RYU JU-JITSOM I STAV PREMA TOJ VJEŠTINI
ВишеMicrosoft Word - tumacenje rezultata za sajt - Lektorisan tekst1
ПРИЛОГ ЗА ТУМАЧЕЊЕ РЕЗУЛТАТА ИСТРАЖИВАЊА TIMSS 2015 У међународном испитивању постигнућа TIMSS 2015 по други пут је у нашој земљи испитивано постигнуће ученика четвртог разреда у области математике и природних
ВишеINDIKATIVNI GODIŠNJI PLAN OBJAVE NATJEČAJA ZA PODUZETNIKE U GODINI IZ OPERATIVNOG PROGRAMA KONKURENTNOST I KOHEZIJA 1. POVEĆANJE RAZVOJA NOVIH P
INDIKATIVNI GODIŠNJI PLAN OBJAVE NATJEČAJA ZA PODUZETNIKE U 2018. GODINI IZ OPERATIVNOG PROGRAMA KONKURENTNOST I KOHEZIJA 1. POVEĆANJE RAZVOJA NOVIH PROIZVODA I USLUGA KOJI PROIZLAZE IZ AKTIVNOSTI ISTRAŽIVANJA
ВишеPosjet poduzeću Model Pakiranja d.d je u sklopu kolegija Menadžment ljudskih potencijala organizirana terenska nastava i posjet poduzeću M
Posjet poduzeću Model Pakiranja d.d. 23.5.2019. je u sklopu kolegija Menadžment ljudskih potencijala organizirana terenska nastava i posjet poduzeću Model Pakiranja. Studente je kroz poduzeće vodio g.
Вишеvoith.com Energetski učinkoviti na svim cestama Zračni kompresori
voith.com Energetski učinkoviti na svim cestama Zračni kompresori 1 2 1 Actros iz Daimlera 2 Volvo Bus 8900 Energetski učinkoviti na putu Zračni kompresori iz Voitha Na povijesnoj lokaciji Zschopau / Sachsen
ВишеMicrosoft PowerPoint - BATERIJA_testova1.ppt
BATERIJA TESTOVA ZA OTKRIVANJE POREMEĆAJA SLUŠNOG PROCESIRANJA Mladen Heđever,, Maja Vincek, Senka Sardelić Edukacijsko-rehabilitacijski fakultet POREMEĆAJI SLUŠNOG PROCESIRANJA TERMINOLOGIJA: (C)APD:
ВишеIzmjena natječajne dokumentacije br. 3 Ograničenog poziva na dostavu projektnih prijedloga Izgradnja kapaciteta za programsko financiranje visokih uči
Izmjena natječajne dokumentacije br. 3 Ograničenog poziva na dostavu projektnih prijedloga Izgradnja kapaciteta za programsko financiranje visokih učilišta BROJ POZIVA: HR.3.1.17 U Pozivu na dostavu projektnih
ВишеVol 5, Broj 17, 7. siječnja Zdravlje u Virovitičko podravskoj županiji Trendovi konzumiranja droga među mladima Virovitičko podravske županije (
Vol 5, Broj 17, 7. siječnja 2009. Zdravlje u Virovitičko podravskoj županiji Trendovi konzumiranja droga među mladima Virovitičko podravske županije (Trend in drug consumption among young people in Virovitica
ВишеEUROPSKA KOMISIJA Bruxelles, C(2018) 533 final PROVEDBENA ODLUKA KOMISIJE (EU) / оd o ujednačenim detaljnim specifikacijama za pri
EUROPSKA KOMISIJA Bruxelles, 2.2.2018. C(2018) 533 final PROVEDBENA ODLUKA KOMISIJE (EU) / оd 2.2.2018. o ujednačenim detaljnim specifikacijama za prikupljanje i analizu podataka u cilju praćenja i ocjenjivanja
ВишеMicrosoft Word - 6. RAZRED INFORMATIKA.doc
Kriteriji ocjenjivanja i vrednovanja INFORMATIKA - 6. razred Nastavne cjeline: 1. Život na mreži 2. Pletemo mreže, prenosimo, štitimo, pohranjujemo i organiziramo podatke 3. Računalno razmišljanje i programiranje
Више30-Findak.indd
Vladimir Findak KINEZIOLOŠKA PARADIGMA PRIMJENE ODGOJNO-OBRAZOVNE TEHNOLOGIJE U PODRUČJU KINEZIOLOŠKE EDUKACIJE 1. UVOD Ekspanzija znanstvenih i tehnoloških otkrića, ubrzana globalizacija i informatizacija
ВишеMicrosoft PowerPoint - Inoviraj_Dan prozora_2016.ppt [Način kompatibilnosti]
Projekti i sredstva iz EU fondova (unaprjeđenje proizvodnje i energetski učinkoviti i održivi proizvodi) Zagreb, Hotel Antunović,23.03.2016. Međunarodna konferencija DAN PROZORA 2016 Strateški i programski
ВишеREPUBLIKA HRVATSKA VARAŽDINSKA ŽUPANIJA GRAD VARAŽDIN VI. osnovna škola Varaždin Dimitrija Demetra 13 Varaždin, OBRAZAC ZA WEB Informacije
REPUBLIKA HRVATSKA VARAŽDINSKA ŽUPANIJA GRAD VARAŽDIN VI. osnovna škola Varaždin Dimitrija Demetra 13 Varaždin, 20.09.2018. OBRAZAC ZA WEB Informacije o predmetu Ime i prezime učitelja: Vesna Gašparić,
ВишеMicrosoft Word - test pitanja pripremna docx
CITOLOGIJA 1 Biološka disciplina koja se bavi proučavanjem organizacije ćelije se naziva: a. histologija b. genetika c. citologija d. ornitologija 2 Osnovna gradivna i funkcionalna jedinica živih bića
ВишеAM_Ple_LegReport
6.12.2018 A8-0417/158 Amandman 158 Uvodna izjava 21. (21) Studije, uključujući ispitivanja, koje poslovni subjekti podnose u sklopu zahtjeva za odobrenje na temelju sektorskih propisa Unije o hrani obično
Више